أصدر سمو الشيخ حمدان بن راشد آل مكتوم نائب حاكم دبي وزير المالية والصناعة بدولة الإمارات العربية المتحدة في مارس عام 1998م قرارا بتخصيص جائزة تسمى (جائزة حمدان بن راشد آل مكتوم للأداء التعليمي المتميز) تتولى مهمة الارتقاء بالأداء التعليمي في كافة مراحله وقطاعاته التابعة لإشراف وزارة التربية والتعليم.

اقتصر النطاق الجغرافي للجائزة في سنتها الأولى على إمارة دبي تضمنت تسع فئات هي المدرسة المتميزة والمعلم المتميز والطالب المتميز والأخصائي الاجتماعي المتميز والموجه المتميز وأفضل ابتكار علمي وأفضل مشروع مطبق وولي الأمر المتميز، وكان للنجاح المنقطع النظير الذي حققته الجائزة في أولى دوراتها والاستجابة المجتمعية المتفاعلة دافعا لسمو راعي الجائزة ـ حفظه الله ـ نحو قرار سموه بتعميم الجائزة على مستوى جميع الإمارات ورفع سقف قيمتها وأنصبتها واستحداث فئتين جديدتين هما فئة الإدارة المدرسية المتميزة وفئة المنطقة التعليمية المتميزة، ووصل عدد الجوائز إلى 172 جائزة.

وفي نوفمبر من عام 2000م، صدر المرسوم السامي رقم (25) لسنة 2000م من المغفور له بإذن الله الشيخ مكتوم بن راشد آل مكتوم ـ حاكم دبي آنذاك ـ بإنشاء جائزة حمدان بن راشد آل مكتوم للأداء التعليمي المتميز، تصبح للجائزة شخصيتها المعنوية وتتمتع بالأهلية الكاملة للتصرف وفق أغراضها ونظامها الأساسي.

وفي ختام الدورة الثانية التي كانت في العام نفسه، أصدر سمو راعي الجائزة تعليماته بإضافة فئة جديدة هي المعلم فائق التميز تأكيدا لمكانة المعلم ورسالته ودوره في بناء الأجيال، كما تم تعديل فئة ولي الأمر المتميز لتصبح الأسرة المتميزة ورفع نصابها إلى 5 وقيمة جائزتها أيضا.
في مارس من عام 2001، أصدر سمو راعي الجائزة توجيهاته بإنشاء مركز لرعاية الموهوبين والمتميزين يتبع الجائزة ويكون نواة لاحتضان الموهوبين وتخريج النخب العلمية والفكرية المبدعة.

وفي غضون فترة زمنية قصيرة أصبح المركز عضوا في المجلس العالمي لرعاية الموهوبين بفضل إنجازاته القيمة.
وفي ختام الدورة الرابعة عام 2002م، أعلن سمو راعي الجائزة إضافة فئتين جديدتين للجائزة هما فئة أفضل بحث تربوي وفئة الإدارة المركزية المتميزة، ليكتمل العقد بشمول الجائزة لكافة عناصر المنظومة التربوية والتعليمية.

وفي بادرة كريمة توج سمو راعي الجائزة اهتمامه ورعايته لقطاع التربية والتعليم بقرار سموه تعميم الجائزة على دول مجلس التعاون الخليجي في فئات الطالب المتميز والمعلم المتميز والمدرسة والإدارة المدرسية المتميزة، وكان ذلك في ختام الدورة الخامسة، لتبدأ بذلك مرحلة تاريخية جديدة من الأداء التعليمي في المنطقة تتمحور فلسفته في محاكاة الإبداع والتميز.

وفي ختام الدورة الثامنة عام 2006، أطلق سمو الشيخ حمدان بن راشد آل مكتوم ـ حفظه الله ورعاه ـ العنان للجائزة للانطلاق نحو آفاق أوسع، لتعم فائدتها أشقاءنا في الدول العربية، بصدور توجيهات سموه بتعميم جائزة فئة أفضل بحث تربوي على جميع الدول العربية وتم استحداث فئة جديدة تحت مسمى فئة أفضل بحث تربوي تطبيقي على مستوى الوطن العربي لتكون بذلك الفئة الرابعة عشرة.

في الدورة التاسعة وجه سمو راعي الجائزة بتكريم المؤسسات الداعمة للتعليم في دولة الامارات العربية المتحدة سواء كانت تلك المؤسسات محلية أو خارجية ، وتم  استحداث جائزة المؤسسات الداعمة للتعليم في الدورة الحادية عشرة عام 2009.
 
وفي حفل ختام الدورة العاشرة عام 2008 أعلن سمو راعي الجائزة عن مبادرته الدولية بتخصيص جائزة عالمية بالتعاون مع منظمة الأمم المتحدة للتربية والثقافة والعلوم ( اليونسكو ) تعنى بتطوير أداء المعلمين ، وتم تدشين  الجائزة في 15 مارس 2009 بمقر اليونسكو بالعاصمة الفرنسية باريس تحت مسمى " جائزة حمدان بن راشد أل مكتوم / اليونسكو لمكافأة الممارسات والجهود المتميزة لتحسين أداء المعلمين ، وتنظم مرة كل عامين .
 
كما أعلن سمو راعي الجائزة في ختام الدورة الحادية عشرة عن استحداث 3 فئات للتعليم العالي هي الطالب الجامعي المتميز وأفضل ابتكار علمي وأفضل مشروع مطبق ، على أن تنظم فعاليتها في الدورة الثانية عشرة . 

وفيما يلي يوضح الجدول فئات الجائزة ونصابها وجوائزها ونطاقها الجغرافي: